Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CXCL3P19876 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CXCL3P19876 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CXCL3P19876 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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