Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms