Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms