Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODC1P11926 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODC1P11926 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODC1P11926 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODC1P11926 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODC1P11926 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODC1P11926 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODC1P11926 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms