Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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