Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOP08100 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOP08100 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOP08100 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms