Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFLP07196 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFLP07196 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEFLP07196 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEFLP07196 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEFLP07196 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEFLP07196 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEFLP07196 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEFLP07196 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEFLP07196 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEFLP07196 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEFLP07196 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEFLP07196 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFLP07196 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEFLP07196 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms