Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1AO95602 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms