Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PRAMEF10O60809 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PRAMEF10O60809 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PRAMEF10O60809 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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PRAMEF10O60809 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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PRAMEF10O60809 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PRAMEF10O60809 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PRAMEF10O60809 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PRAMEF10O60809 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PRAMEF10O60809 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PRAMEF10O60809 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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