Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms