Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF208O43345 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms