Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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GGTLC3B5MD39 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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GGTLC3B5MD39 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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GGTLC3B5MD39 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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GGTLC3B5MD39 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
GGTLC3B5MD39 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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GGTLC3B5MD39 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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