Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
B4DXG7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
B4DXG7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
B4DXG7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
B4DXG7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
B4DXG7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
B4DXG7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms