Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HMGB1P1B2RPK0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms