Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms