Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MAPRE3Q9UPY8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms