Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

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Length 1,222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SORCS3Q9UPU3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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