Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCML1Q9UN30 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms