Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms