Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms