Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSPNQ9HAW4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms