Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZCCHC2Q9C0B9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms