Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRINP2Q9C0B6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms