Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PTDSS2Q9BVG9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms