Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
THUMPD3Q9BV44 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
THUMPD3Q9BV44 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms