Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GPA33Q99795 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms