Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms