Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAVIN3Q969G5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAVIN3Q969G5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms