Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CNIH3Q8TBE1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CNIH3Q8TBE1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CNIH3Q8TBE1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CNIH3Q8TBE1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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