Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L2Q8NAA4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms