Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RYBPQ8N488 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RYBPQ8N488 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms