Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBP4Q8N2S1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP4Q8N2S1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP4Q8N2S1 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP4Q8N2S1 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP4Q8N2S1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP4Q8N2S1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP4Q8N2S1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBP4Q8N2S1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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