Protein–RNA interactions for Protein: Q86WT6

TRIM69, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM69, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM69Q86WT6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM69Q86WT6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM69Q86WT6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms