Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARMIL2Q6F5E8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms