Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms