Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RFTN2Q52LD8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms