Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COL24A1Q17RW2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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