Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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RTN1Q16799 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RTN1Q16799 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RTN1Q16799 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RTN1Q16799 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RTN1Q16799 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RTN1Q16799 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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