Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NTRK2Q16620 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NTRK2Q16620 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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