Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms