Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCEA2Q15560 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms