Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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RAB35Q15286 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB35Q15286 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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