Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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