Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SLC10A1Q14973 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms