Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1699.9 ms