Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP1A4Q13733 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP1A4Q13733 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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