Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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