Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKD2Q13563 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKD2Q13563 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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