Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEUROD1Q13562 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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