Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
UBE2V1Q13404 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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UBE2V1Q13404 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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